近年来,合成生物学的研究如火如荼地开展,其目的在于构建人工分子生物系统并执行定制的功能。
来自湖南大学的研究团队使用DNA分子反应网络封装在原生细胞中,以此构建了一种可以持续处理生物环境中波动生物信息的分子CPU(mCPU),该研究成果发表于国际期刊Science Advances(IF=14.96)。原生细胞(protocell)的合成是该领域的一大挑战,下文为此研究团队中的王老师分享的一些相关经验。
1合成原理
原生细胞的特点是含有微米级大小的空腔和外部的双层磷脂膜。本论文采用反相微乳液方法制备人工的原生细胞,其特点是几乎可以封装任何物质,包括蛋白,核酸和微纳颗粒,并可以此定制用户定义的分子生物系统。
该方法首先将小体积的水溶液加入到大体积(至少10倍)的磷脂油相中,制成大量油包水的乳液,即单层的微米级腔室。然后将该乳液滴入到含有单层磷脂的水相中,即可获得双层磷脂的原生细胞。其中,封装的物质均溶解在小体积的水溶液中。
2合成步骤
准备油相
首先将储备溶液(溶解在10 μL CHCl3 中的50 mg/mL 磷脂溶液POPC)completely干燥。然后加入 1 mL 矿物油以溶解脂质膜,如 1.5 mL Eppendorf 管A,通过在 85°C 下孵育直到不再可见未溶解的 POPC。
准备水相
将所需的 DNA 链溶解在含有 5 mM Mg2+的 280 mM 蔗糖中,作为B管中的内部水相。C管是500μL含有单层磷脂的外部水相,由含有 5 mM Mg2+的DPBS 或280 mM葡萄糖,并在水相顶部加入200 μL POPC溶液。
制备乳液
将 20 μL 内溶液移液到 400 μL 油包脂质中,然后在水浴中超声处理 30 至 60 分钟以形成油包水乳液。
制备原生细胞
将乳液在室温下平衡 2 分钟并覆盖在管 C 的界面溶液上,然后在离心机中静态孵育 5 分钟。通过以 5000g 离心 5 分钟,获得底部的原生细胞,并在 4 °C 下储存。
3注意事项
重点难点1
高浓度的磷脂溶液需要肠辞尘辫濒别迟别濒测干燥,最好在小容量的玻璃瓶中旋蒸,使之铺成一层的白色薄膜。否则后期很难迟丑辞谤辞耻驳丑溶解,会形成大量团絮状的油相杂质。为此,后续的矿物油溶解和乳液形成过程中必要时可以超声。
重点难点2
从乳液到原生细胞的过程中,很多人无法通过离心获得沉淀产物。因为内部水相和外部水相没有形成密度差,本文采用的是280 mM蔗糖溶液作为外部水相,280 mM 葡萄糖溶液或DPBS作为内部水相。值得一提的是,在两者形成密度差的同时,需要保持渗透压相同以防止原生细胞破裂。
经过本文实验,280 mM蔗糖溶液与DPBS渗透压相同,均等同于生理条件下的渗透压285-305 mOsm/kg,因此该原生细胞可以在生理条件下与自然细胞相互作用。
管叠的乳液加入到管颁的外部水相中需要一段时间的静态平衡,使得单层磷脂的乳液充分接触单层油水界面。
以上为王老师原生细胞合成的经验分享,希望对大家有所帮助。同时也欢迎更多老师参与文献奖励活动,分享您的科研干货和心得体会!